Znajdź nas na:

PRZYGOTOWANIE BIBLIOTEK DO SEKWENCJONOWANIA DNA. NA SEKWENATORACH NOWEJ GENERACJI

Data rozpoczęcia 2018-05-11 PRZYGOTOWANIE BIBLIOTEK DO SEKWENCJONOWANIA DNA.  NA SEKWENATORACH NOWEJ GENERACJI
Data zakończenia 2018-05-12
Organizator MBS - Szkolenia, Konferencje, Usługi Sp. z o.o.
Miejsce Warszawa
Branże Farmacja, Biotechnologia, Kosmetologia
Email rekrutacji mbs@mbs.biz.pl
Dodaj do kalendarza Ical_outlook Google_calendar

PRZYGOTOWANIE BIBLIOTEK DO SEKWENCJONOWANIA DNA.

NA SEKWENATORACH NOWEJ GENERACJI

 

Jednym z podstawowych zadań biologii molekularnej jest poznanie struktury i funkcji genomów. Rozwój metod pozwala sekwencjonować DNA coraz szybciej i dokładniej. Obecnie na rynku są aparaty kilku producentów – Illumina (MiSeq, HiSeq, NextSeq), Thermo Scientific (PMG, Proton), Pacific Biosciences (PACBIO RSII, Sequel), Oxford Nanopores (MinION, GridIon, PromethION). Mają one różne możliwości i ograniczenia. Użytkownicy mogą wybrać odpowiadający im aparat lub zlecić sekwencjonowanie. Kluczowym momentem, wspólnym dla wszystkich aparatów jest właściwe przygotowanie bibliotek. Niniejszy kurs umożliwi Państwu praktyczne i teoretyczne zapoznanie się z przygotowaniem bibliotek do sekwencjonowania DNA.

 

PROGRAM KURSU

I dzień

09:00 – 09:10

Otwarcie kursu

09:10 – 10:00

Przygotowanie DNA do sekwencjonowania na NGS i planowanie eksperymentów – wykład I

10:00 – 10:40

Wydzielanie DNA – ćwiczenie 1

10:40 – 11:00

Pomiar ilości DNA – ćwiczenie 2

11:00 – 11:20

Fragmentacja DNA – ćwiczenie 3

11:20 – 12:00

Oczyszczanie fragmentowanego DNA – ćwiczenie 4

12:00 – 12:30

Ocena fragmentacji DNA – ćwiczenie 5

12:30 – 13:45

Przygotowanie bibliotek DNA do sekwencjonowania – wykład II

13:45 – 14:00

Przygotowanie biblioteki – ćwiczenie 6

Część A. Naprawa końców pofragmentowanego DNA

14:00 – 14:30

Przerwa

14:30 – 15:00

Przygotowanie biblioteki – ćwiczenie 6

Część B. Oczyszczanie po naprawie końców

15:00 – 15:15

Przygotowanie biblioteki – ćwiczenie 6

Część C. dA-Tiling

15:15 – 16:00

Sekwenatory nowej generacji (NGS) – ich możliwości i ograniczenia w sekwencjonowaniu genomów - wykład III

II dzień

09:00 – 09:40

Przygotowanie biblioteki – ćwiczenie 6

Część D. Oczyszczanie po dA-tilingu

09:40 – 10:30

Przygotowanie biblioteki – ćwiczenie 6

Część E. Ligacja adapterów

10:30 – 11:10

Przygotowanie biblioteki – ćwiczenie 6

Część F. Oczyszczanie produktów ligacji

11:10 – 11:25

Przygotowanie biblioteki – ćwiczenie 6

Część G. Amplifikacja biblioteki

11:25 – 12:25

Resekwencjonowanie i składanie de novo genomów - wykład IV

12:25 – 12:40

Przerwa

12:40 – 13:20

Przygotowanie biblioteki – ćwiczenie 6

Część H. Oczyszczanie biblioteki

13:20 – 13:50

Ocena wielkości wbudowanych fragmentów – ćwiczenie 7

13:50 – 14:00

Pomiar stężenia przygotowanej biblioteki – ćwiczenie 8

14:00 – 14:15

Interpretacja wyników

14:15

Zakończenie

 

 

Prowadzący: dr hab. Tadeusz Malewski,

 

Termin: 11 - 12 maja 2018 roku

 

Miejsce: Muzeum i Instytut Zoologii PAN, ul. Wilcza 64, Warszawa

 

Karty Zgłoszenia oraz opłaty należy przesyłać do dnia 4 maja 2018 r.

 

Ponieważ ilość miejsc jest ograniczona organizatorzy zastrzegają sobie prawo do wcześniejszego zamknięcia listy w przypadku wyczerpania wolnych miejsc.

 

Dodatkowych informacji udziela:

 

Dr Arleta Malewska: mbs@mbs.biz.pl, Tel (22) 668 24 83; 607 929 471

 

Opłata za udział w kursie wynosi 1400 zł + 23% VAT

 

Opłata obejmuje:

  • udział w szkoleniu
  • materiały szkoleniowe
  • przerwy kawowe
  • konsultacje z prowadzącym

Opłatę należy wpłacić na konto:

MBS Szkolenia, Konferencje, Usługi Sp. z o.o.

03-766 Warszawa, ul. Grajewska 6/8 m. 26

 

Bank Polska Kasa Opieki S.A. Oddział w Warszawie

80 1240 6074 1111 0010 4915 6042

NIP 113 286 12 19; REGON 146448470; KRS 0000444499

 

Przy wpłacie prosimy o podanie nazwiska osoby, której udział w kursie jest opłacany.

 

Uczestnicy otrzymają dyplom ukończenia szkolenia

Pasaż laboratoryjny

events

Laboratoria w Polsce

Nasze czasopismo - Laborant

Limit_200x300_ok_adka_laborant_8

Numer 8/2014

Temat przewodni: Diagnostyka laboratoryjna